生物肥料中氮磷的配比更加科學，既能發揮肥料和水的作用，又能促進底泥中氮磷向水體的釋放。生物肥添加的有機肥改變了傳統的畜禽糞便直接添加到天然有機肥源中，分解過程中無細菌感染，耗氧量低。

　　在正常條件下，施肥效果可以持續7天左右。施肥的水色由黃綠色到黃褐色，主要由硅藻、裸藻、隱藻、綠藻、輪蟲等餌料價值高的浮游生物組成，與傳統施肥有明顯區別。

　　其中所含的微量元素不僅可以直接被水生生物利用，還可以與水體底部的一些有害物質結合起來，減輕其毒性，降低其毒性。同時在肥料中加入特殊物質，具有較強的吸附沉淀作用，能減少水體中的懸浮物和分解底質中的有害物質。

　　因此，應將不溶性泥漿倒入水中，以免影響施肥效果。生物肥料能促進水生植物的光合作用，豐富水中的溶解氧，對調節水質、改善底質也有很好的效果。可以促進水體生產力與環境的科學和諧統一。